El nuevo ministro de Educación apoyó, en su calidad de rector de la Universidad Autónoma de Madrid y presidente de la CRUE, la reivindicación de un trato no discriminatorio en la evaluación del profesorado que vienen solicitando las editoriales universitarias españolas en los últimos meses ante la CNEAI. Gabilondo es autor de varios libros, publicados por las editoriales universitarias: La fiesta del ser nuevo (Universidad de Oviedo), La vuelta del otro, diferencia, identidad y alteridad (Universidad Autónoma de Madrid), Hablar y dejar hablar (Sobre racismo y xenofobia) (Universitat Autònoma de Barcelona). Es autor de muchas otras obras, cuyos datos pueden consultarse en Dialnet. Algunos ensayos están publicados íntegramente en dicha página.